目的:分析肺泡灌洗液宏基因组二代测序(Metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术在痰菌阴性肺结核患者诊断中的应用价值.方法:选取 2020 年 1 月至2023 年12 月我院收治的60 例痰菌阴性疑似肺结核患者作为研究对象,所有患者均采集肺泡灌洗液标本,并行抗酸染色及mNGS技术检查,以临床诊断结果为金标准,分析两种检查手段的诊断效能.结果:临床诊断结果显示,60 例痰菌阴性疑似肺结核患者中,48 例痰菌阴性肺结核患者,12 例非肺结核患者;所有患者中被确诊为痰菌阴性肺结核患者 48 例,以男性(60.42%)、年龄＜50 岁(68.75%)、有吸烟史(52.08%)、病灶累及右肺上叶(47.92%)、形态为肺叶/段实变(72.92%)等为主;肺泡灌洗液mNGS技术诊断痰菌阴性肺结核的准确度、敏感度分别为 90.00%、87.50%,高于抗酸染色诊断的 73.33%、68.75%(P＜0.05).结论:肺泡灌洗液mNGS技术对痰菌阴性肺结核具有较高的诊断效能,相较于抗酸染色能提高诊断的准确度及敏感度.