生物信息学分析tspear表达在结直肠癌患者预后评估中的作用及机制
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天津市医学重点学科(专科)建设项目 ( TJYXZDXK-058B ) 天津市自然科学基金 ( 21JCYBJC01070 ) 北京科创医学发展基金 ( KC2021-JX-0186-93 ) 天津市卫生健康委员会中医中西医结合科研重点课题 ( 2023056 )


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    目的:基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据集,探索tspear基因在结直肠癌中的预后作用及机制.方法:自TCGA获取数据,应用R语言分析结直肠癌组织和正常组织间tspear mRNA的表达差异及TSPEAR表达与临床病理特征之间的相关性.采用Kaplan-Meier分析、比例风险回归分析(Cox's proportional hazards regression model,Cox)和列线图确定tspear对结直肠癌患者总生存率和疾病特异性生存率的预测价值.对tspear 相关的差异表达基因进行基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)、基因本体富集(Gene Ontology,GO)和信号通路富集(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG).结果:tspear在结直肠癌中的表达显著增加,其表达升高与肿瘤T分期、M分期、残余肿瘤、总生存期和疾病特异性生存期显著相关.单变量Cox回归分析表明tspear是结直肠癌生存率的预测因子.多变量Cox回归分析显示tspear是结直肠癌的独立预后因素.KEGG分析显示tspear相关差异表达基因主要富集于神经活性配体-受体相互作用通路.结论:tspear可能是一种新的结直肠癌独立预后生物标志物.

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引用本文

韩旺;王娟;徐靖.生物信息学分析tspear表达在结直肠癌患者预后评估中的作用及机制[J].四川生理科学杂志,2024,46(5):945-950

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